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農林水産省は、2025年9月5日、「高病原性鳥インフルエンザに関する防疫作業マニュアル(一般動員者、民間事業者用)」をWebサイトで公開した。現場での防疫処置の実際に合わせ、マニュアルが整備された。

マニュアルは66頁のpdfで、構成は以下の通り。

• Ⅰ．本マニュアルについて
• Ⅱ．高病原性鳥インフルエンザとは
• Ⅲ．防疫作業の流れ
• Ⅳ．防疫作業体制及び作業内容
• 1. 作業者に関する班編制と役割分担
  2. 防疫作業各係における作業内容
  3. 集合施設の設置
  4. 農場周辺の消毒
  5. 仮設テントの設営及び作業確認
  6. 防疫作業の健康管理
• Ⅴ．殺処分
• 1. 基本的な作業の流れ
  2. 殺処分作業にあたっての留意事項
  3. 殺処分の進め方
• Ⅵ．殺処分後の作業
• 1. 焼埋却場所などへの運搬
  2. 汚染物品の回収・処分と使用機器、作業場所の消毒
  3. 農場からの退出
• Ⅶ．埋却作業
• 1. 基本的な作業の流れ
  2. 埋却地の選定と試堀
  3. 埋却作業の実施
• Ⅷ．消毒作業
• 1. 基本的な考え方
  2. 消毒薬の選定
  3. 発生農場における消毒
  4. 消毒ポイントの設置と車両の消毒
  5. 器具・機材の消毒
  6. 消毒薬の使用、保管、廃棄に当たっての注意事項

• 参考資料1「用語解説」
• 参考資料2「動員者の持ち物と・注意事項について」
• 参考資料3「防護具の着脱について」
• 参考資料4「防疫作業のチームリーダー等の役割と留意事項」
• 参考資料5「集合施設における作業前の準備」
• 参考資料6「バイオセキュリティと作業者の安全確保のために遵守すべき事項」
• 参考資料7「作業中の健康管理」
• 参考資料8「鶏の保定方法」
• 参考資料9「発生農場におけるネズミ対策について」
• 参考資料10「埋却作業における作業者の安全確保」
• 参考資料11「埋却地を農地として再利用する場合の埋め戻し手順例」
• 参考資料12「埋却にかかる雨天作業時の留意事項」
• 参考資料13「家きん排泄物、飼料等の封じ込め処理について」
• 参考資料14「鳥インフルエンザウイルスに効果がある消毒薬」
• 参考資料15「炭酸ソーダを使用するときの注意」
• 参考資料16「家きん舎周囲及び農場外縁部への消石灰散布のイメージ」
• 参考資料17「消石灰の取り扱いについて」
• 参考資料18「消毒ポイントの設置の考え方、消毒対象について」