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環境省は、2023年4月4日、全国のニホンジカとイノシシの2021年度末時点における個体数推定等の結果を発表した(参照：環境省プレスリリース)。同省では、全国的な生息状況の動向を把握するため、統計手法を用いた両種の個体数の推定等を2013年度から実施している。
本州以南のニホンジカの個体数は、中央値で約222万頭(90％信用区間：約192万～265万頭)、イノシシの個体数は、中央値で約72万頭(90％信用区間：約54万～97万頭)と推定された。
両種の個体数とも、2014年度をピークに減少傾向が継続しているが、ニホンジカの個体数は高い水準にある。